醫學資訊(Medical Informatic:MI)入門課程:醫學數位內容
課程目標:
了解常見數位資料格式，熟悉某種臨床專業資料，看得懂資料處理程式範例，會修改範例程式進一步應用。
課程內容:
- 程式語言入門: C或JS 入門(含簡易之檔案處理、HTTP、網頁或視窗介面程式)。同學至少學一種程式，看得懂程式語法，可依據課程程式範例做簡單修改及應用
- 學會使用工具及程式分析常見之數位資料格式: 配合所學文書處理、數位資料檢視工具、及程式，分析處理常見之數位資料格式。如下: bit、byte、文字及數位資料檔案、XML 及 JSON 結構化文件
- 至少熟悉並能處理一種專業的臨床醫學數位內容: 課程將介紹臨床醫療常見的資料，例如電子病歷、醫學影像、生醫訊號、基因序列等臨床醫療產生的資料規格。並以程式範例，分析、處理、網路傳輸、及呈現上述資料
- 專題初體驗: 了解某一健康醫療資訊化整合應用情境及其資訊互通架構。配合此情境及架構，修改提供之範例程式，進行某類臨床醫療資料之存取、規格轉換、呈現、或分析處裡
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專題範例:
- 設計輸入介面，方便民眾居家輸入血壓、心跳、體溫、血糖等數值，並轉換成醫資標準規格，上傳到健康照護平台
- 取得病人最近幾周每天量測的血壓、體溫、血糖等資料，並以表格或圖表呈現，利於醫護人員檢視及說明
- 取得標準化醫療平台上之病人基本資料、看診資料、檢驗檢查結果，將資料轉換成 HTML (或 pdf) 文件呈現
- 將臨床醫療量測的波形資料(如心電圖MIT ECG EBM ECG 、腦波等)轉換成標準規格，並於視窗或網頁介面中呈現
- 參考病理 virtual slide 系統(類似 google map) ，產生縮圖及截圖資訊。配合前端介面縮圖點選座標，呈現大圖部分內容
- 依據醫學影像呈現及標記程式範例醫學影像呈現及標記程式範例 ，取得標記座標資訊。設計使用介面，加入標記之解剖或病變說明資訊，轉換成醫資標準規格，上傳到 web 醫學影像平台
- 程式處理病變(或不同物種)之NGS 基因序列檢測資料。提供介面如 NGS IGV 範例 ，讓使用者瀏覽及選取特定基因片段，呈現其異變與參考基因的差異狀況(ATGC) 差異狀況